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1.

Global Trends in Marine Plankton Diversity across Kingdoms of Life.

Ibarbalz, Federico M; Henry, Nicolas; Brandão, Manoela C; Martini, Séverine; Busseni, Greta; Byrne, Hannah; Coelho, Luis Pedro; Endo, Hisashi; Gasol, Josep M; Gregory, Ann C; Mahé, Frédéric; Rigonato, Janaina; Royo-Llonch, Marta; Salazar, Guillem; Sanz-Sáez, Isabel; Scalco, Eleonora; Soviadan, Dodji; Zayed, Ahmed A; Zingone, Adriana; Labadie, Karine; Ferland, Joannie; Marec, Claudie; Kandels, Stefanie; Picheral, Marc; Dimier, Céline; Poulain, Julie; Pisarev, Sergey; Carmichael, Margaux; Pesant, Stéphane; Babin, Marcel; Boss, Emmanuel; Iudicone, Daniele; Jaillon, Olivier; Acinas, Silvia G; Ogata, Hiroyuki; Pelletier, Eric; Stemmann, Lars; Sullivan, Matthew B; Sunagawa, Shinichi; Bopp, Laurent; de Vargas, Colomban; Karp-Boss, Lee; Wincker, Patrick; Lombard, Fabien; Bowler, Chris; Zinger, Lucie.

Cell; 179(5): 1084-1097.e21, 2019 11 14.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31730851

2.

Warming effects on lizard gut microbiome depend on habitat connectivity.

Fromm, Emma; Zinger, Lucie; Pellerin, Félix; Di Gesu, Lucie; Jacob, Staffan; Winandy, Laurane; Aguilée, Robin; Parthuisot, Nathalie; Iribar, Amaia; White, Joël; Bestion, Elvire; Cote, Julien.

Proc Biol Sci; 291(2021): 20240220, 2024 Apr 30.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38654642

3.

Molecular ecology of microbiomes in the wild: Common pitfalls, methodological advances and future directions.

Fountain-Jones, Nicholas M; Giraud, Tatiana; Zinger, Lucie; Bik, Holly; Creer, Simon; Videvall, Elin.

Mol Ecol; 33(2): e17223, 2024 Jan.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38014746

4.

Best practices in metabarcoding of fungi: From experimental design to results.

Tedersoo, Leho; Bahram, Mohammad; Zinger, Lucie; Nilsson, R Henrik; Kennedy, Peter G; Yang, Teng; Anslan, Sten; Mikryukov, Vladimir.

Mol Ecol; 31(10): 2769-2795, 2022 05.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35395127

5.

Connecting high-throughput biodiversity inventories: Opportunities for a site-based genomic framework for global integration and synthesis.

Arribas, Paula; Andújar, Carmelo; Bidartondo, Martin I; Bohmann, Kristine; Coissac, Éric; Creer, Simon; deWaard, Jeremy R; Elbrecht, Vasco; Ficetola, Gentile F; Goberna, Marta; Kennedy, Susan; Krehenwinkel, Henrik; Leese, Florian; Novotny, Vojtech; Ronquist, Fredrik; Yu, Douglas W; Zinger, Lucie; Creedy, Thomas J; Meramveliotakis, Emmanouil; Noguerales, Víctor; Overcast, Isaac; Morlon, Hélène; Vogler, Alfried P; Papadopoulou, Anna; Emerson, Brent C.

Mol Ecol; 30(5): 1120-1135, 2021 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33432777

6.

Disentangling the assembly mechanisms of ant cuticular bacterial communities of two Amazonian ant species sharing a common arboreal nest.

Birer, Caroline; Moreau, Corrie S; Tysklind, Niklas; Zinger, Lucie; Duplais, Christophe.

Mol Ecol; 29(7): 1372-1385, 2020 04.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32133714

7.

Altered trophic interactions in warming climates: consequences for predator diet breadth and fitness.

Bestion, Elvire; Soriano-Redondo, Andrea; Cucherousset, Julien; Jacob, Staffan; White, Joël; Zinger, Lucie; Fourtune, Lisa; Di Gesu, Lucie; Teyssier, Aimeric; Cote, Julien.

Proc Biol Sci; 286(1914): 20192227, 2019 11 06.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31662087

8.

The relative importance of ecological drivers of arbuscular mycorrhizal fungal distribution varies with taxon phylogenetic resolution.

Roy, Julien; Mazel, Florent; Sosa-Hernández, Moisés A; Dueñas, Juan F; Hempel, Stefan; Zinger, Lucie; Rillig, Matthias C.

New Phytol; 224(2): 936-948, 2019 10.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31355954

9.

Body size determines soil community assembly in a tropical forest.

Zinger, Lucie; Taberlet, Pierre; Schimann, Heidy; Bonin, Aurélie; Boyer, Frédéric; De Barba, Marta; Gaucher, Philippe; Gielly, Ludovic; Giguet-Covex, Charline; Iribar, Amaia; Réjou-Méchain, Maxime; Rayé, Gilles; Rioux, Delphine; Schilling, Vincent; Tymen, Blaise; Viers, Jérôme; Zouiten, Cyril; Thuiller, Wilfried; Coissac, Eric; Chave, Jérôme.

Mol Ecol; 28(3): 528-543, 2019 02.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30375061

10.

Mapping the imprint of biotic interactions on ß-diversity.

Ohlmann, Marc; Mazel, Florent; Chalmandrier, Loïc; Bec, Stéphane; Coissac, Eric; Gielly, Ludovic; Pansu, Johan; Schilling, Vincent; Taberlet, Pierre; Zinger, Lucie; Chave, Jérome; Thuiller, Wilfried.

Ecol Lett; 21(11): 1660-1669, 2018 11.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30152092

11.

Chemical regulation of body feather microbiota in a wild bird.

Jacob, Staffan; Sallé, Louis; Zinger, Lucie; Chaine, Alexis S; Ducamp, Christine; Boutault, Léa; Russell, Andrew F; Heeb, Philipp.

Mol Ecol; 27(7): 1727-1738, 2018 04.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29533479

12.

Contrasting microbial biogeographical patterns between anthropogenic subalpine grasslands and natural alpine grasslands.

Geremia, Roberto A; PuÈcaÈ, Mihai; Zinger, Lucie; Bonneville, Jean-Marc; Choler, Philippe.

New Phytol; 209(3): 1196-207, 2016 Feb.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26443332

13.

Coalescing molecular evolution and DNA barcoding.

Zinger, Lucie; Philippe, Hervé.

Mol Ecol; 25(9): 1908-10, 2016 05.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27169389

14.

Metagenome skimming for phylogenetic community ecology: a new era in biodiversity research.

Papadopoulou, Anna; Taberlet, Pierre; Zinger, Lucie.

Mol Ecol; 24(14): 3515-7, 2015 Jul.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26174127

15.

Reconstructing long-term human impacts on plant communities: an ecological approach based on lake sediment DNA.

Pansu, Johan; Giguet-Covex, Charline; Ficetola, Gentile Francesco; Gielly, Ludovic; Boyer, Frédéric; Zinger, Lucie; Arnaud, Fabien; Poulenard, Jérôme; Taberlet, Pierre; Choler, Philippe.

Mol Ecol; 24(7): 1485-98, 2015 Apr.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25735209

16.

DNA metabarcoding-Need for robust experimental designs to draw sound ecological conclusions.

Zinger, Lucie; Bonin, Aurélie; Alsos, Inger G; Bálint, Miklós; Bik, Holly; Boyer, Frédéric; Chariton, Anthony A; Creer, Simon; Coissac, Eric; Deagle, Bruce E; De Barba, Marta; Dickie, Ian A; Dumbrell, Alex J; Ficetola, Gentile Francesco; Fierer, Noah; Fumagalli, Luca; Gilbert, M Thomas P; Jarman, Simon; Jumpponen, Ari; Kauserud, Håvard; Orlando, Ludovic; Pansu, Johan; Pawlowski, Jan; Tedersoo, Leho; Thomsen, Philip Francis; Willerslev, Eske; Taberlet, Pierre.

Mol Ecol; 28(8): 1857-1862, 2019 04.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31033079

17.

Beyond reaction norms: the temporal dynamics of phenotypic plasticity.

Dupont, Léonard; Thierry, Mélanie; Zinger, Lucie; Legrand, Delphine; Jacob, Staffan.

Trends Ecol Evol; 39(1): 41-51, 2024 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-37718228

18.

A robust approach to estimate relative phytoplankton cell abundances from metagenomes.

Pierella Karlusich, Juan José; Pelletier, Eric; Zinger, Lucie; Lombard, Fabien; Zingone, Adriana; Colin, Sébastien; Gasol, Josep M; Dorrell, Richard G; Henry, Nicolas; Scalco, Eleonora; Acinas, Silvia G; Wincker, Patrick; de Vargas, Colomban; Bowler, Chris.

Mol Ecol Resour; 23(1): 16-40, 2023 Jan.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35108459

19.

Two decades of describing the unseen majority of aquatic microbial diversity.

Zinger, Lucie; Gobet, Angélique; Pommier, Thomas.

Mol Ecol; 21(8): 1878-96, 2012 Apr.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22093148

20.

Toward global integration of biodiversity big data: a harmonized metabarcode data generation module for terrestrial arthropods.

Arribas, Paula; Andújar, Carmelo; Bohmann, Kristine; deWaard, Jeremy R; Economo, Evan P; Elbrecht, Vasco; Geisen, Stefan; Goberna, Marta; Krehenwinkel, Henrik; Novotny, Vojtech; Zinger, Lucie; Creedy, Thomas J; Meramveliotakis, Emmanouil; Noguerales, Víctor; Overcast, Isaac; Morlon, Hélène; Papadopoulou, Anna; Vogler, Alfried P; Emerson, Brent C.

Gigascience; 112022 07 19.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35852418

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